Keichi Morisato est un jeune étudiant à l'université Nekomi Kodai mais malheureusement, il est poursuivit par la malchance. Il ne plait pas aux filles à cause de sa taille, il vit dans un dortoir de garçons avec deux "maîtres" qui lui font faire toutes les corvées, etc... Mais, malgré ça, il possède un bon coeur, et Dieu voit bien ça ! Un jour Dieu fait entrer Keichi en contact avec le bureau d'aide des déesses via un coup de téléphone. De ce fait une déesse du nom de Belldandy apparait derrière et lui propose de lui accorder un voeu...
