Il s'agit d'une nouvelle adaptation du roman Boogiepop wa Warawana de Kouhei Kadono. Ce nouvel anime fête les 20 ans de la série. Il existe une légende urbaine selon laquelle il y aurait un shinigami qui peut libérer les gens de la souffrance qu'ils peuvent ressentir. Cet "Ange de la Mort" a un nom : Boogiepop. Et les légendes sont vraies. Boogiepop est réel. Quand une vague de disparitions impliquant des étudiantes éclate à l'académie de Shinyo, la police et l'établissement supposent qu'il s'agit juste d'une série de fugues. Mais Nagi Kirima, une étudiante de l'académie, le sait: quelque chose de mystérieux et de mauvais est en train de se produire. Est-ce Boogiepop, qui en est à l'origine, ou quelque chose de plus sinistre...?
